RESUMEN

Introducción: En los últimos años las infecciones ocasionadas por micobacterias no tuberculosas han tenido un incremento notable en varias regiones del mundo, asociado fundamentalmente a infecciones respiratorias en individuos inmunocomprometidos. La identificación de micobacterias no tuberculosas es engorrosa y puede demorar varias semanas. Objetivo: Aplicar las técnicas moleculares GenoType Mycobacterium CM/AS para la identificación de micobacterias no tuberculosas en Cuba y comparar con los resultados de la prueba convencional. Material y métodos: Se utilizaron 73 aislados de micobacterias no tuberculosas procedentes de muestras pulmonares recibidas de unidades de salud ubicadas en varias provincias de Cuba en el período abril 2017-diciembre 2018. Para la identificación de especies se utilizaron técnicas convencionales y las técnicas moleculares GenoType CM/AS. Resultados: Las especies identificadas más predominantes fueron las pertenecientes al complejo Mycobacterium avium-intracellulare (46.6%) y Mycobacterium fortuitum (31.5%). Se hallaron cuatro aislados de M. simiae, especie poco frecuente en Cuba. Al comparar los resultados de ambas técnicas se obtuvo una concordancia de 91.3%. Conclusión: Las técnicas GenoType Mycobacterium CM/AS demostraron ser herramientas útiles en la identificación rápida de micobacterias en el Laboratorio de Referencia, brindando resultados precisos en menor tiempo, logrando acortar significativamente el tiempo diagnóstico. Las especies más frecuentes en Cuba siguen siendo el complejo Mycobacterium avium-intracellulare y Mycobacterium fortuitum.

PALABRAS CLAVE

Micobacterias no tuberculosas, identificación de especie, GenoType Mycobacterium CM, GenoType Mycobacterium AS.

REFERENCIAS

1. Tortoli E. Microbiological features and clinical relevance of new species of the genus Mycobacterium. Clin Microbiol Rev 2014; 27(4):727-752. doi: 10.1128/CMR.00035-14.

2. Hoefsloot W, van Ingen J, Andrejak C, et al. Nontuberculous Mycobacteria Network European Trials Group. The geographic diversity of nontuberculous mycobacteria isolated from pulmonary samples: An NTM-NET collaborative study. Eur Respir J 2013;42(6):1604-1613. doi: 10.1183/09031936.00149212.

3. Mederos LM, Fleites G, Capó V, De Armas Y, et al. Infección diseminada por Mycobacterium szulgai con compromiso pulmonar y ganglionar en un paciente con sida. SIIC 2012; 18(8):776-780.

4. Mederos CLM, Reyes PA, Valdes AL, et al. Coinfección por Mycobacterium malmoense y Mycobacterium tuberculosis en paciente con el síndrome de inmunodeficiencia humana. Rev Peru Med Exp Salud Pública 2014;31(4):788-792.

5. Mederos LM, Fleites G, Acosta MA, et al. Micobacteriosis peritoneal por Mycobacterium avium-intracellulare en paciente con el síndrome de inmunodeficiencia adquirida. SIIC 2017; 22:352-356.

6. 6 Godoy MJ, Orozco L, Hernández C, et al. Identificación de micobacterias no tuberculosas: comparación de métodos bioquímicos y moleculares. Rev Soc Ven Microbiol 2008;28(2):1315-2556.

7. Leiva CT. Evaluación de una técnica de hibridación reversa para identificación rápida de micobacterias en Chile. Rev Chil Enf Respir 2012; 28:9-15. doi.org/10.4067/S0717-73482012000100002.

8. GenoType Mycobacterium CM VER 2.0. Fecha de acceso: diciembre 2018. Disponible en: www.hain-lifescience.de.

9. GenoType Mycobacterium AS VER 1.0. Fecha de acceso: diciembre 2018. Disponible en: www.hain-lifescience.de.

10. Runyon EH. Anonymous mycobacteria in pulmonary disease. Med Clin North Am 1959;43(1):273-290.

11. Fernández de Vega FA, Moreno JE, González Martín J, et al. Micobacterias. En: Cercenado E, Cantón R, editores. Procedimientos en microbiología clínica. España: editorial; 2005.p.12-39.

12. Lee AS, Jelfs P, Sintchenko V, Gilbert LG. Identification of non-tuberculous mycobacteria: utility of the GenoType Mycobacterium CM/AS assay compared with HPLC and 16S rRNA gene sequencing. J Med Microbiol 2009;58(Pt 7):900-904. doi: 10.1099/jmm.0.007484-0.

13. Singh AK, Maurya AK, Umrao J, et al. Role of GenoType (®) Mycobacterium Common Mycobacteria/Additional Species Assay for Rapid Differentiation Between Mycobacterium tuberculosis Complex and Different Species of Non-Tuberculous Mycobacteria. J Lab Physicians 2013;5(2):83-89. doi: 10.4103/0974-2727.119847.

14. Springer B, Stockman L, Teschner K, Roberts GD, Böttger EC. Two-laboratory collaborative study on identification of mycobacteria: molecular versus phenotypic methods. J Clin Microbiol 1996;34(2):296-303.

15. Castillo A, Díaz M, Mederos LM, et al. Infección pulmonar por micobacterias ambientales en pacientes VIH/SIDA atendidos en el Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí, enero 2006-junio 2008. Rev Panam Infectol 2013;15(1-4):33-40.

16. Mederos CLM, Martínez RMR, Sardiñas AM, et al. Utilidad del cultivo rápido en medio líquido Bact/Alert 3D en el diagnóstico micobacteriano de muestras clínicas. AVFT 2016;35(3):77-82.

17. Nasiri MJ, Dabiri H, Fooladi AAI, Amini S, Hamzehloo G, Feizabadi MM. High rates of nontuberculous mycobacteria isolation from patients with presumptive tuberculosis in Iran. New Microbes New Infect 2017; 21:12-18. doi: 10.1016/j.nmni.2017.08.008.

18. Valdivia JA, Suárez MR, Echemendía MA. Mycobacterium habana: probable nueva especie dentro de las micobacterias no clasificadas. Bol Hig Epid 1971;9:65-73.

19. Richter E, Rüsch-Gerdes S, Hillemann D. Evaluation of the GenoType Mycobacterium Assay for identification of mycobacterial species from cultures. J Clin Microbiol 2006; 44(5):1769-1775.

20. Gitti Z, Neonakis I, Fanti G, Kontos F, Maraki S, Tselentis Y. Use of the GenoType Mycobacterium CM and AS assays to analyze 76 nontuberculous mycobacterial isolates from Greece. J Clin Microbiol 2006;44(6):2244-2246.